Método Taguchi para optimizar marcadores RAPD-PCR y determinar diversidad genética: un modelo, la tortuga cabezona Caretta caretta (Testudines: Cheloniidae)
| dc.creator | Martínez-Ortega, Julio | |
| dc.date | 2013-06-28 | |
| dc.date.accessioned | 2017-03-31T17:44:07Z | |
| dc.date.accessioned | 2017-08-05T16:59:10Z | |
| dc.date.available | 2017-03-31T17:44:07Z | |
| dc.date.available | 2017-08-05T16:59:10Z | |
| dc.description | Se implementó el método Taguchi para optimizar marcadores RAPD-PCR que permitan estimar la diversidad genética con el modelo: tortuga cabezona. Se aisló ADN de C. caretta de dos zonas del Caribe colombiano (Don Diego N = 5 e Islas del Rosario N = 3) y se cuantificó. Se aplicó una matriz ortogonal de Taguchi para estandarizar cuatro variables para la reacción RAPD-PCR. Los datos obtenidos se analizaron con el programa PopGen. Las condiciones estandarizadas se encontraron con 7,85 ng/μl de ADN, 3,5 mM de MgCl2, 200 mM de dNTP´s, 0,5 μM de oligonucleótido y una unidad de Taq ADN polimerasa, en un volumen final de reacción de 20 μl. Las condiciones de termociclado iniciaron a 94°C por 5 m, seguido de 40 ciclos de: 94°C por 40 s, 37°C por 40 s y 72°C por 90 s. Los marcadores se registraron en una matriz binaria de presencia (1) y ausencia (0), y como un ejemplo modelo se determinó la diversidad genética utilizando el índice de Shannon (H´= 0,44+/–0,27 individuos de Don Diego y de H´= 0,25+/–0,32 para Isla del Rosario), el índice promedio de estructura genética (Gst = 0,27) y el índice de migración efectiva (Nm = 1,28). Se estandarizó una metodología haciendo uso del método de Taguchi que produce bandas claras, legibles y reproducibles, método que puede emplearse como alternativa confiable para realizar estudios de diversidad genética en la tortuga cabezona o de otras especies, y adicionalmente, integrarlos en el currículo de biología molecular y/o bioquímica para estudiantes de pregrado y maestría. | es-ES |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.identifier.citation | Martínez-Ortega, J., & Hernández-Fernández, J. (1). Método Taguchi para optimizar marcadores RAPD-PCR y determinar diversidad genética: un modelo, la tortuga cabezona Caretta caretta (Testudines: Cheloniidae). Revista Mutis, 3(1), 20. https://doi.org/10.21789/22561498.840 | spa |
| dc.identifier.doi | 10.21789/22561498.840 | |
| dc.identifier.other | https://doi.org/10.21789/22561498.840 | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12010/661 | |
| dc.language | spa | |
| dc.publisher | Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano | es-ES |
| dc.source | Revista Mutis; Vol. 3, Núm. 1 (2013); 20 | es-ES |
| dc.source | 2256-1498 | |
| dc.subject | Biología marina | es-ES |
| dc.subject | método Taguchi; matriz ortogonal; RAPD-PCR; Caretta caretta; diversidad genética | es-ES |
| dc.subject.lemb | Diversidad animal | spa |
| dc.subject.lemb | Tortugas | spa |
| dc.subject.lemb | Biodiversidad | spa |
| dc.title | Método Taguchi para optimizar marcadores RAPD-PCR y determinar diversidad genética: un modelo, la tortuga cabezona Caretta caretta (Testudines: Cheloniidae) | es-ES |
| dc.type.driver | info:eu-repo/semantics/article | spa |
| dc.type.hasversion | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | spa |
| dc.type.local | Artículo revisado por pares | spa |
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