Recolecta y análisis de información para el estudio de comunidades microbiológicas y su asociación con corales.

Aguilar Peña, Germán Daniel

Recolecta y análisis de información para el estudio de comunidades microbiológicas y su asociación con corales.

dc.contributor.advisor	Ruiz Toquica, Jordan Steven
dc.contributor.advisor	Rincón Díaz, Natalia
dc.coverage.spatial	Colombia	spa
dc.creator	Aguilar Peña, Germán Daniel
dc.creator.degree	Biólogo(s) marino	spa
dc.date.accessioned	2023-09-27T14:47:52Z
dc.date.available	2023-09-27T14:47:52Z
dc.date.created	2023
dc.description.abstract	La obtención de material biológico y genético es fundamental y la base para el estudio de las comunidades microbianas que se encuentran asociadas a los corales. Este trabajo se enfocó en recolectar y analizar información relacionada con las condiciones ambientales, biológicas y microbiológicas, tanto en campo como en condiciones experimentales, orientado en preparar el estudio de las comunidades microbianas a asociadas a corales en la bahía de Chengue e Inca Inca, Santa Marta, Magdalena. Así pues, se registraron datos de temperatura, salinidad, concentración de oxígeno y pH, provenientes de los sitios de muestreo. Además, se determinó la cobertura, frecuencia de interacciones y signos de deterioro dentro de las formaciones arrecifales. Asimismo, se extrajo ADN total microbiano a partir de muestras de tejido y mucus de los corales recolectados durante la época seca de 2022-2023 y la lluviosa de 2022. Por último, se examinó el estado de un vivero de fragmentos de coral, recolectando información sobre parámetros fisicoquímicos y condiciones de aclimatación, con el fin de preparar los fragmentos para experimentos posteriores. La información acá presentada sirve de base parala toma de decisiones a futuro y contribuye al desarrollo de estudios que permitan revelar la respuesta del microbioma asociado a los corales bajo diferentes condiciones	spa
dc.description.abstractenglish	Obtaining biological and genetic material is fundamental and the basis for the study of microbial communities that are associated with corals. This work focused on collecting and analyzing information related to environmental, biological and microbiological conditions, both in the field and in experimental conditions, aimed at preparing the study of microbial communities associated with corals in the bay of Chengue and Inca Inca, Santa Marta, Magdalena. Thus, temperature, salinity, oxygen concentration and pH data were recorded from the sampling sites. In addition, the coverage, frequency of interactions and signs of deterioration within the reef formations were determined. Total microbial DNA was also extracted from tissue and mucus samples from corals collected during the 2022-2023 dry season and the 2022 rainy season. Finally, the state of a coral fragment nursery was examined, collecting information on physicochemical parameters and acclimatization conditions, in order to prepare the fragments for further experiments. The information presented here serves as a basis for future decision-making and contributes to the development of studies that reveal the response of the microbiome associated with corals under different conditions	spa
dc.description.hashtag	#MaterialBiológico	spa
dc.description.hashtag	#Corales	spa
dc.description.hashtag	#ChengueInca	spa
dc.description.rda	Requerimientos de sistema: Adobe Acrobat Reader	spa
dc.format.extent	25 páginas	spa
dc.format.mimetype	text/html	spa
dc.format.rda	1 recurso en línea (archivo de texto)	spa
dc.identifier.repourl	http://expeditio.utadeo.edu.co	spa
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12010/32050
dc.language.iso	spa	spa
dc.publisher	Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano	spa
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería	spa
dc.publisher.program	Biología marina	spa
dc.relation.references	Barott, K. L., Rodriguez, B., Janouškovec, J., Marhaver, K. L., Smith, J. E., Keeling, P., y Rohwer, F. L. 2011. Microbial diversity associated with four functional groups of benthic reef algae and the reef‐building coral Montastraea annularis. Environmental microbiology, 13(5), 1192-1204.	spa
dc.relation.references	Borneman, E. 2008. Introduction to the husbandry of corals in aquariums: A review. Public Aquar. Husb. Ser, 2, 3-14.	spa
dc.relation.references	Bourne, D. G., y Munn, C. B. 2005. Diversity of bacteria associated with the coral Pocillopora damicornis from the Great Barrier Reef. Environmental microbiology, 7(8), 1162-1174.	spa
dc.relation.references	Calixto, R., Portz, L., Manzolli, R., Oliveira, L., Suarez, J., Acevedo, T. y Schorr, C. 2020. Evaluación espaciotemporal de los efectos de estresores ambientales sobre la microbiota coralina y la salud de los arrecifes coralinos del caribe colombiano. Corporación Universidad de la Costa.	spa
dc.relation.references	Doering, T., Wall, M., Putchim, L., Rattanawongwan, T., Schroeder, R., Hentschel, U. y Roik, A. 2021. Towards enhancing coral heat tolerance: a "microbiome transplantation" treatment using inoculations of homogenized coral tissues. Microbiome, 9(1), 102 p.	spa
dc.relation.references	Forsman, Z., Rinkevich, B., y Hunter, C. 2006. Investigating fragment size for culturing reefbuilding corals (Porites lobata and P. compressa) in ex situ nurseries. Aquaculture, 261(1), 89-97.	spa
dc.relation.references	Gardner, T., Côté, I., Gill, J., Grant, A., y Watkinson, A. 2003. Long-term region-wide declines in Caribbean corals. science, 301(5635), 958-960	spa
dc.relation.references	Garren, M., y Azam, F. 2010. New method for counting bacteria associated with coral mucus. Applied and environmental microbiology, 76(18), 6128-6133.	spa
dc.relation.references	Herrera, C. 2022. Búsqueda preliminar de candidatos a microorganismos benéficos para corales a partir del mucus y tejido de Madracis auretenra (Scleractinia: Pocilloporidae). Tesis de grado Biología marina. Universidad Jorge Tadeo Lozano. Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería. Santafé de Bogotá. 56 p.	spa
dc.relation.references	Kimes, N. E., van Nostrand, J. D., Weil, E., Zhou, J., y Morris, P. J. 2010. Microbial functional structure of Montastraea faveolata, an important Caribbean reef‐building coral, differs between healthy and yellow‐band diseased colonies. Environmental microbiology, 12(2), 541-556.	spa
dc.relation.references	Lee, S. T., Davy, S. K., Tang, S. L., y Kench, P. S. 2016. Mucus sugar content shapes the bacterial community structure in thermally stressed Acropora muricata. Frontiers in microbiology, 7, 371.	spa
dc.relation.references	Lirman, D., y Schopmeyer, S. 2016. Ecological solutions to reef degradation: optimizing coral reef restoration in the Caribbean and Western Atlantic. PeerJ, 4, e2597.	spa
dc.relation.references	López, I., Flórez, L., y Quan-Young, L. 2020. Influencia de la herbivoría sobre la interacción alga-coral en un arrecife coralino de bahía Capurganá, Caribe colombiano. Revista de Biología Tropical, 68(3), 729-742.	spa
dc.relation.references	McDevitt, J. M., Baum, J. K., Garren, M., y Vega, R. L. 2017. Responses of coral-associated bacterial communities to local and global stressors. Front. Mar. Sci. 4:262. doi: 10.3389/fmars.2017.00262.	spa
dc.relation.references	Mejia, N. 2001. Efecto e incidencia de las interacciones alga – coral en comunidades coralinas de dos bahías de la regio de Santa Marta (Caribe colombiano) con distinto grado de influencia antropogénica. Tesis de grado Biología marina. Universidad Jorge Tadeo Lozano. Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería. Santafé de Bogotá. 188 p.	spa
dc.relation.references	Ocampo, H., Rodríguez, F. A., y Becerril, A. 2021. Más allá del cambio climático: Implicaciones de la contaminación marina por agroquímicos sobre las interacciones simbióticas y el éxito ecológico de los corales. E-CUCBA, (15), 1–9. https://doi.org/10.32870/e-cucba.v0i15.174	spa
dc.relation.references	Ramos, A., García, U., De Los Santos, C., y Aguirre, M. 2018. Metagenómica marina: un enfoque al descubrimiento de nuevos biosurfactantes para su posible aplicación ambiental. En R. Zamora (Ed), Avances y perspectivas de la biotecnología en la península de Yucatán. 208-226.	spa
dc.relation.references	Reshef, L., Koren, O., Loya, Y., Zilber, I., y Rosenberg, E. 2006. The Coral Probiotic Hypothesis. Environ Microbiol, 8(12), 2068-2073.	spa
dc.relation.references	Ritchie, K. B., y Smith, G. W. 2004. Microbial communities of coral surface mucopolysaccharide layers. In Coral Health and Disease. New York: Springer-Verlag, 259-263	spa
dc.relation.references	Robles, A., Reyes, H., y Cáceres, C. 2021. Crecimiento y supervivencia de corales durante la fase inicial de cultivo en La Paz, Baja California Sur, México. Revista mexicana de biodiversidad, 92(4), 7	spa
dc.relation.references	Rodríguez, R., Báez, D., Valcárcel, A., Evangelista, D., Bello De Lillo, Y., y Matos, J. 2022. Importancia de los viveros de coral y su impacto socioeconómico. AULA Revista de Humanidades y Ciencias Sociales, 68(1), 78-91	spa
dc.relation.references	Smith, S. et al. 2018. Coral-associated bacteria demonstrate phylosymbiosis and cophylogeny. Nat Commun 9, 4921. https://doi.org/10.1038/s41467-018-07275-x	spa
dc.relation.references	Teplitski, M., y Ritchie, K. 2009. How feasible is the biological control of coral diseases?. Trends in ecology & evolution, 24(7), 378-385	spa
dc.relation.references	Valenzuela, F., Casillas, R., Villalpando, E., y Vargas, F. 2015. El gen ARNr 16S en el estudio de comunidades microbianas marinas. Ciencias marinas, 41(4), 297-313.	spa
dc.relation.references	Van Oppen, M. J. H., y Blackall, L. L. 2019. Coral microbiome dynamics, functions and design in a changing world. Nature Reviews Microbiology. doi:10.1038/s41579-019-0223-4	spa
dc.relation.references	Vega, J., Rodríguez, A., Reyes, M., y Navas, R. 2008. Formaciones coralinas del área de Santa Marta: estado y patrones de distribución espacial de la comunidad bentónica. Boletín de Investigaciones Marinas y Costeras-INVEMAR, 37(2), 87-105.	spa
dc.relation.references	Velázquez, L., Martínez, M., y Romero, A. 2014. Extracción y purificación de ADN. Herramientas moleculares aplicadas en ecología: aspectos teóricos y prácticos, 1.	spa
dc.relation.references	Villamizar, E. 2021. Impactos de los derrames de petróleo sobre los arrecifes coralinos y sus bienes y servicios ecosistémicos. Boletín de la Academia de Ciencias Físicas, Matemáticas y Naturales, LXXXI(1), 45-52.	spa
dc.relation.references	Weber, L., DeForce, E., y Apprill, A. 2017. Optimization of DNA extraction for advancing coral microbiota investigations. Microbiome, 5, 1-14.	spa
dc.relation.references	Westmacott, S., Teleki, K., Wells, S., y West, J. 2000. Manejo de arrecifes de coral blanqueados o severamente dañados VII. (G. Fragoso, Trad.) Cambridge: UICN.	spa
dc.relation.references	Wild, C., Niggl, W., Naumann, M., y Haas, A. F. 2010. Organic matter release by Red Sea coral reef organisms—potential effects on microbial activity and in situ O2 availability. Marine Ecology Progress Series, 411, 61-71.	spa
dc.relation.references	Zambrano, S., y Villalpando, M. 2020. Plan para el estudio de la epizootiología de corales: guía para la evaluación, seguimiento y manejo preventivo de enfermedades y blanqueamiento de coral en la República Dominicana.	spa
dc.relation.references	Ziegler, M., Séneca, F., Yum, L. et al. 2017. La dinámica de la comunidad bacteriana está vinculada a los patrones de tolerancia al calor de los corales. Nat Commun 8 , 14213. https://doi.org/10.1038/ncomms14213	spa
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/restrictedAccess	spa
dc.rights.license	EL AUTOR, manifiesta que la obra objeto de la presente autorización es original y la realizó sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto la obra es de exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre la misma. PARGRAFO: En caso de presentarse cualquier reclamación o acción por parte de un tercero en cuanto a los derechos de autor sobre la obra en cuestión, EL AUTOR, asumirá toda la responsabilidad, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos la universidad actúa como un tercero de buena fe. EL AUTOR, autoriza a LA UNIVERSIDAD DE BOGOTA JORGE TADEO LOZANO, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre la materia, utilice y use la obra objeto de la presente autorización. POLITICA DE TRATAMIENTO DE DATOS PERSONALES. Declaro que autorizo previa y de forma informada el tratamiento de mis datos personales por parte de LA UNIVERSIDAD DE BOGOTÁ JORGE TADEO LOZANO para fines académicos y en aplicación de convenios con terceros o servicios conexos con actividades propias de la academia, con estricto cumplimiento de los principios de ley. Para el correcto ejercicio de mi derecho de habeas data cuento con la cuenta de correo protecciondatos@utadeo.edu.co, donde previa identificación podré solicitar la consulta, corrección y supresión de mis datos	spa
dc.rights.local	Acceso restringido	spa
dc.source	Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano	spa
dc.source	Expeditio Repositorio Institucional UJTL	spa
dc.subject	Comunidades microbianas	spa
dc.subject	ADN microbiano	spa
dc.subject.lemb	Corales	spa
dc.subject.lemb	Biología marina	spa
dc.subject.lemb	Aspectos ambientales	spa
dc.title	Recolecta y análisis de información para el estudio de comunidades microbiológicas y su asociación con corales.	spa
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f	spa
dc.type.hasversion	info:eu-repo/semantics/acceptedVersion	spa
dc.type.local	Trabajo de grado de pregrado	spa