ARDRA para la identificación de las bacterias coliformes Citrobacter sedlakii y Citrobacter gilleni, del humedal “Laguna de Tierra Blanca” Soacha, Cundinamarca
Fecha
2012Autor
Becerra, Laura
Puentes, Viviana
Martínez, Julio
Fernández, Javier Hernández
Documentos PDF
Resumen
Muestras de agua del humedal “Laguna de Tierra Blanca” de Soacha, Cundinamarca, fueron
sembradas en agar MacConkey y EMB. Una colonia verde metálico, catalasa positiva y oxidasa
negativa se resembró de nuevo en agar EMB y fue sometida a la prueba bioquímica API E20. Se
extrajo el DNA, se amplificó el gen 16S rRNA por PCR y se cortó con las endonucleasas de
restricción AluI y HpyCH4III. Un análisis de ARDRA in silico fue realizado para 11 secuencias del
gen 16S rRNA de todas las especies del género, reportadas en GenBank. El sistema API E20 reveló
la presencia de Citrobacter sp. El análisis de ARDRA mostró que el patrón de bandas generado por
HpyCH4III no presentó ninguna coincidencia con los reportados en GenBank. AluI presentó seis
bandas con tamaños de 592, 338, 368, 227, 95, 92 y 49 pb, coincidiendo con las bandas in silico
reportadas para las especies Citrobacter sedlakii y Citrobacter gillenii, presentándose para cada
especie bacteriana una banda adicional. La banda de 367 pb identificó a C. gillenii y la de 338 pb
a.C. sedlakii, concluyéndose que la colonia aislada contenía posiblemente estas dos cepas
bacterianas.
Resumen en idioma extranjero
Water samples from the wetland "Laguna de Tierra Blanca" Soacha-Cundinamarca were isolated in
MacConkey agar and EMB. A metallic green, catalase positive, and oxidase negative colony was
reisolated again in EMB agar. The colony was subjected to biochemical test API E20. DNA was
extracted, amplified 16S rRNA gene by PCR and cut with restriction endonucleases AluI and
HpyCH4III. An in silico ARDRA analysis was performed to 11 sequences of 16S rRNA genes from all
species of the genus reported in GenBank. The API E20 system revealed the presence of Citrobacter
sp. ARDRA analysis showed that the banding pattern generated by HpyCH4III made no agreement
with those reported in GenBank. AluI showed 6 bands with sizes of 592, 338, 368, 227, 95, 92 and 49
bp, coinciding with the in silico bands reported for Citrobacter species and C. sedlakii and C. gillenii,
for each bacterial species presenting an additional band. The band of 367 bp identified C. gillenii and
338 bp of a. C. sedlakii, concluding that the single colony may contain these two bacterial strains.
Palabras clave
ARDRA; Citrobacter gillenii; Citrobacter sedlakii; Endonucleasas; In silicoEnlace al recurso
https://revistas.utadeo.edu.co/index.php/mutis/article/view/360Colecciones
- Año 2012 [126]
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Comentarios
Respuesta Comentario Repositorio Expeditio
Gracias por tomarse el tiempo para darnos su opinión.