Identificación molecular de la tortuga caguama Caretta Caretta (Testudines: Cheloniidae) utilizando el gen Mitocondrial Citocromo C oxidasa I (COI)
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Date
2011Advisor
Hernández Fernández, Javier Adolfo
Hashtag(s)
#TortugaCaguamaMetadata
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Abstract
La tortuga caguama Caretta caretta es una especie en peligro de extinción debido a la interacción de características típicas como crecimiento lento, maduración sexual tardía, explotación antrópica y destrucción del hábitat. Para extender el conocimiento sobre la especie y contribuir a su conservación se identificó taxonómicamente la tortuga caguama usando marcadores moleculares. Se obtuvieron 8 muestras de sangre de especímenes juveniles de C. caretta provenientes de la playa de anidación Don Diego (n=5) e Islas Del Rosario (Sitio de alimentación) (n=3) en el Caribe colombiano. Se aisló el DNA y se estandarizó la amplificación del gen mitocondrial Citocromo c oxidasa I (COI) por PCR extra-rápida obteniendo fragmentos de alrededor de 650 pares de bases, disminuyendo a un tercio el tiempo de reacción. El producto amplificado de COI se analizó con las enzimas de restricción HindIII, HpyCH4III y MseI generando un perfil electroforético que al ser comparado in silico con secuencias previamente descritas para las demás especies de tortugas marinas, permitió identificar patrones específicos para las especies: Caretta caretta, Dermochelys coriacea y Lepidochelys kempii; así como un patrón compartido por Chelonia mydas y Natator depressa y otro por Eretmochelys imbricatta y Lepidochelys olivacea.
Summary in foreign language
The loggerhead turtle Caretta caretta is in the risk of extinction due to the interaction of typical characteristics like slow grow rate, late sexual development, human exploitation and habitat loss. To extend the knowledge of the species and help on its conservation the loggerhead sea turtle was taxonomically identified by means of molecular marchers. 8 blood samples were obtained from young C.caretta specimens coming from Don Diego beach (Nesting beach) (n=5) and Islas Del Rosario (Feeding ground) (n=3) in the Colombian Caribbean. Whole DNA was isolated and the amplification by Extra-rapid PCR of the mitochondrial gene Cytochrome c oxidase I (COI) was standardized obtaining fragments of about 650 base pairs and lessening to a third the overall reaction time. The amplified COI product was analyzed with HindIII, HpyCH4III and MseI endonucleases therefore creating a fingerprinting that in computer comparisons against other sequences previously described for the remaining species of sea turtle allowed the identification of specific electrophoretic profiles for Caretta caretta, Dermochelys coriacea and Lepidochelys kempii, and a shared profile for Chelonia mydas and Natator depressa and another for Erethmochelys imbricatta and Lepidochelys olivacea.
Palabras clave
Tortuga caguamaCollections
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