Se analizó la composición y la abundancia de las muestras fitoplanctónicas con relación a las condiciones ambientales (temperatura, salinidad y concentración de nutrientes) vigentes durante cada uno de los períodos. Las muestras fueron obtenidas en tres planos de profundidad (0, 25 y 50 m) y a lo largo de cinco años (1996 a 2001) y medio de cruceros oceanográficos sobre la cuenca del Pacífico colombiano (CPC). Se discriminaron 260 especies de diatomeas y 236 de dinoflagelados; las mayores abundancias se observaron entre noviembre y diciembre de 1997 a mayo de 2000, predominando la comunidad de diatomeas sobre los dinoflagelados. Los incrementos de estos últimos se presentaron por el aumento en la temperatura de las aguas circundantes. La distribución espacial de los organismos obedeció al patrón de circulación y al movimiento vertical, de las aguas en el Pacífico colombiano, afectado a la vez por las condiciones climáticas predominantes.