La estructura y dinámica de la comunidad fitoplanctónica en el subembalse del Magdalena (embalse de Betania), fue valorada mediante cuatro salidas de campo entre Septiembre de 2077 y Febrero de 2008. Se tuvieron en cuenta 10 puntos de muestreo ubicados a lo largo del embalse uno dentro de la zona fluvial, cuatro dentro de la zona de transición y cinco en la zona de la presa, nueve de ellos estuvieron ubicados en zonas con influencia de la actividad piscícola. Se encontró un total de 141 especies dentro de las cuales el 61% fueron poco frecuentes. Los taxones encontrados corresponden con los reportados para aguas dulces tropicales y se encuentras repartidas dentro de nueve clases taxonómicas:, Chlorophyceae (38%), Bacillariophyta (18%), Cyanobacteri (15%), Zygnemaphyceae (13%), Euglenophyceae (8%), Chlamydophyceae (4%), Dinophyceae (4%), Chryrophyceae (1%) y Xanthophyceae (1%). El análisis cualitativo mostró que la composición espacial y temporal del fitoplancton estuvo dominada por la clase Chlorophyceae durante todo el tiempo de muestreo siendo representativa la presencia de 22 morfotipos del género Pediatrum y ocho del género Desmodesmus. Con respecto a la densidad se observó que Septiembre fue el mes que obtuvo las mayores densidades y Febrero las menores resultantes de un proceso de dilución. En Septiembre las euglenofíceas se presentaron como el grupo dominante debido a la presencia de Phacus spp relacionado con la mayor concentración de sólidos suspendidos.