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Optimización de marcadores moleculares RAPF-PCR para la caracterización de la tortuga cabezona Caretta Caretta (Testudines: Cheloniidae)
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dc.contributor.advisor | Hernández Fernández, Javier Adolfo | |
dc.coverage.spatial | Bogotá D.C., Colombia | spa |
dc.creator | Martínez Ortega, Julio César | |
dc.date.accessioned | 2017-05-10T21:17:55Z | |
dc.date.accessioned | 2017-08-05T16:25:09Z | |
dc.date.available | 2017-05-10T21:17:55Z | |
dc.date.available | 2017-08-05T16:25:09Z | |
dc.date.created | 2010 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12010/1284 | |
dc.description.abstract | Este estudio evaluó y estandarizó la sensibilidad, especificidad y reproducibilidad de los Polimorfismos de ADN Amplificados al Azar por la Reacción en Cadena de la Polimerasa (RAPD-PCR), con el fin de obtener marcadores genético-moleculares que permitan estimar la diversidad genética de la tortuga cabezona. Se aisló ADN de C. caretta de 2 zonas del Caribe colombiano (Don Diego N=5 e Islas del Rosario N=3) y se cuantificó obteniendo entre 8.63-78.5 ng/?l. Se aplicó una matriz ortogonal de Taguchi que permitió reducir de 81 a 9 el número de reacciones. Las mejores condiciones de la reacción se determinaron evaluando concentraciones de 0.59 a 7.85 ng de ADN, 2 a 4 mM de MgCl2, 1 a 6 Unidades de Taq ADN polimerasa y de 0.1 a 0.5 ?M de oligonucleótidos. Las condiciones estandarizadas se dieron con 7.85 ng/?l de ADN, 3.5 mM de MgCl2, 200 mM de dNTPþs, 0.5 ?M de oligonucleótido y una unidad de Taq ADN Polimerasa, en un volumen de reacción de 20 ?l. Las condiciones de termociclado de la reacción se iniciaron con una desnaturalización a 94°C por 5 m, seguida por 40 ciclos de: 94°C por 40 s, 37°C por 40 s y 72°C por 90 s y una fase de elongación final de 72°C por 5 m. La diversidad genética se determinó utilizando el índice de Shannon obteniendo valores entre 2.19-2.48 para los individuos de Don Diego y entre 0.39-1.38 para los de Isla del Rosario. El índice de Pielou, produjo valores cercanos o iguales a 1. Se estandarizó una metodología que produce bandas claras, legibles y reproducibles, condiciones indispensables para que esta técnica de RAPD pueda utilizarse como alternativa confiable para realizar estudios de diversidad genética en la tortuga cabezona. | spa |
dc.format.mimetype | aplicación/pdf | spa |
dc.language.iso | spa | spa |
dc.publisher | Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano | spa |
dc.source.uri | http://unicornio.utadeo.edu.co/tesis/biologia_marina/T937.pdf | spa |
dc.subject | Biología marina | spa |
dc.subject | Caretta caretta | spa |
dc.subject | Tortuga caguama | spa |
dc.subject | Marcadores genéticos | spa |
dc.subject | Huellas genéticas por adn | spa |
dc.title | Optimización de marcadores moleculares RAPF-PCR para la caracterización de la tortuga cabezona Caretta Caretta (Testudines: Cheloniidae) | spa |
dc.type.local | Trabajo de grado de pregrado | spa |
dc.type.hasversion | info:eu-repo/semantics/acceptedVersion | spa |
dc.rights.local | Abierto (Texto Completo) | spa |
dc.identifier.local | T937 | |
dc.publisher.program | Biología Marina | spa |
dc.description.degreename | Biólogo Marino | spa |
dc.publisher.faculty | Facultad de Biología Marina | spa |
dc.identifier.instname | instname:Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano | spa |
dc.identifier.reponame | reponame:Repositorio Institucional de la Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano | spa |
dc.type.driver | info:eu-repo/semantics/bachelorThesis | spa |
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Biología Marina [349]