Con el fin de determinar si las condiciones físicas y químicas presentes en los sistemas del Acuario Mundo Marino eran óptimas para los animales exhibidos, se muestrearon por un lapso de 16 semanas variables fisicoquímicas tales como temperatura del agua, salinidad, porcentaje de saturación de oxígeno, pH, concentración de nutrientes (amonio, nitritos y ortofosfatos), así como la concentración de algunos pigmentos fotosintéticos. Se encontró que el Acuario Mundo Marino presenta una salinidad alta en los sistemas externos, un porcentaje de saturación de oxígeno en promedio un poco bajo, así como concentraciones altas de nutrientes en todos los acuarios. Por otro lado, la comunidad fitoplanctónica de los sistemas internos presentó un estado de senescencia. El resto de variables se comportaron de acuerdo a los rangos óptimos. Se confirmó también que históricamente estas variables no han fluctuado demasiado (promedio total) comparado con monitoreos realizados en los últimos 9 años. Por otro lado se realizó un experimento con Caulerpa sertularioides con el fin de conocer si el alga podría ser útil en la reducción de la concentración de nutrientes. Se colocaron algas en ciertos acuarios por un periodo de 10 días en dos ocasiones con diferentes densidades en cada una. Se concluyó que el alga si reduce dichas concentraciones, pero su eficacia se da en densidades altas, por lo cual, se recomienda la construcción de un ?refugio de algas?, que permita mejorar los niveles de nutrientes en los sistemas internos.