Entre enero y junio de 1999 se estudió la estructura de la comunidad infaunal asociada a fondos blandos del Parque Nacional Natural Gorgona (Pacífico colombiano), tendiendo en cuenta la variación espacio temporal, la penetrancia de la luz, la salinidad y temperatura a tres profundidades. La muestra de sedimento fue analizada por su composición granulométrica, cantidad de carbonato de calcio y de materia orgánica; la muestra biológica fue tamizada por un ojo de malla de 0,5 mm y los individuos colectados fueron contados, pesados e identificados a nivel de familia. Se contabilizaron 3089 individuos distribuidos en 111 familias correspondientes a 7 taxas (Antozoarios, Anélidos, Moluscos, Crustáceos, Sipuncúlidos, Cefalocordados y Peces). El grupo de poliquetos fue el más importante en abundancia, los crustáceos dominaron en biomasa y los moluscos tuvieron la mayor diversidad. El análisis de similaridad sugiere que hay diferencias significativas entre épocas y sitios de muestreo. El análisis multivariado reveló la existencia e seis ensamblajes asentados en sedimentos tipo gránulo. Temporalmente, la comunidad infaunal varió junto con las variables ambientales en respuesta al fenómeno de surgencia que inicia en mayo culminando en diciembre. No hubo una variable ambiental que explicara de buena forma el patrón de distribución del componente biológico, ya que presentaron coeficientes de correlación bajos.